دفتر مرکزی گروه موسسات مردم نهاد بهارنکو محلی بوده که عوامل اجرایی مثل مدیر عامل، امور اقتصادی، دفتر ارتباطات، امور اداری مالی ، دفتر مدیریت پروژه و دبیرخانه در آن با هدفی مشترک، برای نیل به اهداف و تنظیم گری روابط موسسات تلاش می‌کنند و کمک فراوانی به شکل گیری تعاملات، اطلاع‌رسانی‌ها، تنظیم روابط بین موسسات، برگزاری جلسات شورای گروه موسسات متشکل از مسئولین موسسات، توسعه و پشتیبانی از سامانه کارکنان بهارنکو، پیگیری اجرای سیاست‌های مدیرعامل و هیئت مدیره، تعیین فرآیندهای کلان در گروه موسسات، سیاستگذاری در خصوص تفاهم‌نامه‌ها، قراردادها و سایر همکاری‌ها و اجرای امور مرتبط اداری مالی موسسه مردم‌نهاد بهارنکو دارند.
لازم به ذکر است که دفتر مرکزی گروه موسسات بهارنکو در شیراز خیابان اردیبهشت نبش کوچه ۵ واقع شده است.
